Google検索エンジンにサーバーURLが表示される

Google検索エンジンにホームページURLと同じページ内容の
サーバーURLが表示されてしまいます。

（例）
ホームページURL ：http://ドメイン名/index.php
サーバーURL ：http://サーバーアドレス名/basercms-2.0.5.1/index.php/

サーバーURLを検索エンジンに表示させない方法を教えてください。
よろしくお願い致します。