Re: baserCMSをダウンロードする際にマルウェアが検出されました

Windows Defender がマルウェアだと判断するようです。
Mac/Linuxだけでなく、TrendmicroやSymantecやMcafeeなどのアンチウィルス製品の使用者は影響を受けていないのだと思います。

Windows Defenderを一時的に無効にして作業を行えば、大丈夫ですが、Windows Defenderを無効化するリスクがわかる方のみご実施ください。

[2016/06/03 追記]
河野哲哉さんが、MSにレポートを上げていただいて、ダウンロードが行えるようになったようです。(3.0.9-3.0.10)