3.0.12さくらインターネットのサーバーでbasercmsをインストールした後に独自ドメインを設定するとトップページ以外がエラー

バージョン3.012をサクラサーバーにインストール後に独自ドメインに移行させたいのですが、
トップページはちゃんと反映されたのに、それ以外の階層がすべて「500Internal Server Error」で表示がされません。

構成が変わっていてwebrootなども無くなっているのでhtaccessに何か設定すればいいのか他に必要なのかわかりません。
何かファイルのアップロードの不具合でしょうか

何か手段があればよろしくお願いいたします。

ちなみに管理画面も表示されません。

サクラのURLですと問題なく表示されています。

install.phpの変更では変化ありませんでした。
Configure::write('BcEnv.siteUrl', 'http://独自ドメイン/');

baserCMS環境

設置フォルダ： /home/サクラ初期ドメイン/www/○○○/
セーフモード：Off
データベース： SQLite
baserCMSバージョン： 3.0.12
CakePHPバージョン： 2.5.9



サクラサーバーエラーログ
[Wed Dec 07 11:06:31 2016] [error] [clientxxxxxx] Request exceeded the limit of 10 internal redirects due to probable configuration error. Use 'LimitInternalRecursion' to increase the limit if necessary. Use 'LogLevel debug' to get a backtrace., referer: http://独自ドメイン/