WebARENAのwebメールについて

お世話になっております。

弊社でBaserCMSを利用させていただいております。

質問なのですが、
弊社のレンタルサーバー「WebARENA」で利用できる
WEBメールが使えません。

.htaccessにてスマートURLを
使用しているためだと思うのですが。
※webメールの管理画面には入れるが、画像等のリンクが切れている。

webメールを設置しているフォルダにmode_rewriteの設定を
しようと思いましたが、
WEBメールが設置されているフォルダは通常FTP接続時には
見えなくなっているため、そのフォルダ.htacceseを置くことが出来ません。

なにか解決策があれば教えてください。
よろしくお願いいたします。

•BaserCMSのバージョン：　1.68
•レンタルサーバー名：WebARENA
•スマートURLの利用：　ON
•設置フォルダ：　ドキュメントルート
•利用しているデータベース：　 MySQL
•PHPスキル（自己評価）：　 E